而明安庆府监军道：杨卓然，多次劝说革左五营流寇们速速归降朝廷，但他们却以缺饷为由，竟公然劫掠安庆府潜山县，不得不让围剿的明军们甚至都怀疑流寇们是否是假降？
不过对于流寇们来说，这也是没办法的事！毕竟没有钱粮维持军队，所以只能靠劫掠为生。
恰好朝中东林党官员们因种种顾忌，在招安问题上犹豫不决，更有甚者建议对于流寇则一律斩杀，不可招降，因此纷纷弹劾杨监军，致使招抚革左五营之功臣被削职！
此事被革左五营流寇们听闻风声后，又得知李、张两人，刚刚斩杀了两位大明亲王殿下，而兵部尚书杨阁老因病去世？故此流寇革左五营流寇们，便不在投降。
另外朝廷急诏明凤阳行都督府总镇巡抚：朱大典，进「总督」官职，负责节制；河南都指挥使司、湖广都指挥使司，各镇兵马进驻南直隶庐州府六安州英山县、霍山县，进剿流寇。
此刻身在山东承宣布政使司兖州府藩王封地内的，明鲁安亲王：朱以派，愿意捐出自己鲁亲王府内的黄金数万两，用来招募鲁亲王府仪卫司与鲁亲王府护卫指挥使司人数，以防兖州府流寇劫掠。
随后中原流寇：孟三，攻陷开封府河阴县，立马就被明郏县游击将军：高谦，围攻追击七昼夜，最终斩杀孟三。
3月12日，因明山东总镇巡抚：王国宝，剿贼不利，致使山东承宣布政使司流寇猖狂，朝廷特命明济南府总兵：杨御蕃、明山东总镇总兵：刘泽清，会兵围剿流寇。
很快流寇：西营八大王（张献忠）自知各部流寇不是战死就是招安，唯有联合才能强大，因此他打算东逃与革左五营合兵，在去湖广承宣布政使司黄州府麻城县。
这让明湖广总镇巡抚：宋一鹤，听闻消息后，立刻渡江进驻，屯兵在黄州府蕲州（蕲州卫），配合荆亲王府护卫指挥使司擒拿流寇谍报，并焚船禁止任何人渡河。
4月17日，在开封府收揽势力的闯王：李自成，得到了明宝丰县举人：牛金星，的推荐把谋士：宋献策，成功拉拢到闯军中。
宋献策此人，才智非凡，深受闯王的敬重，凡大小战役计划都必先向他征求意见，之后才能出兵。
他还故意造谣，说道“十八子孩儿，当主中华神器。”
为口号，意思就是～他们不在是流寇了，而是准备推翻大明帝国，建立新政权的正规军了。
当时闯军本部有精兵五千人，步骑十万人开始围攻开封府，使得明五司总督兼兵部尚书：丁启睿，非常害怕。
他不敢轻易援助开封府，但又听说流寇：西营八大王（张献忠）在汝宁府光州光山县、固始县，一带军队很少？
就跟诸将们商量道“今陛下命本部堂剿杀河南承宣布政使司的贼寇，而他张献忠就是这该死的流寇。”
于是就发布檄文令明平贼将军：左良玉，南下攻破黄州府麻城县，击败流寇：西营八大王（张献忠）一部军队，斩杀一千二百人。
紧接着开封府就告急了，但明五司总督兼兵部尚书却认为正与张贼激战着，不能分散兵力去开封府救援。
恰好明都察院右佥都御史兼陕西三边总督：傅宗龙，从牢里被放出来，准备入关督师陕西都指挥使司明军，就被明兵部尚书兼五司总督：丁启睿，上奏请求皇帝陛下更改敕书。
命令明陕西三边总督：傅宗龙，前去开封府攻打闯王：李自成，以解围。
在闯军攻城之际，开封府内的明周孝亲王：朱恭枵，将周亲王府内的金子全部拿出来，共有五十万两黄金与白银，均用来买米、买物资，让那些愿意守城池的士兵们享用。
这也是周亲王殿下的眼光，略高于其他各地的藩王之处。
不仅如此，周亲王殿下还用重金悬赏和招募死士，又发布了王令，宣称道“击杀一贼者，赏金五十两。”
这让明周孝亲王很得民心，也让开封府城内的士兵和百姓们同仇敌忾，纷纷踊跃地参与到守城当中，都想亲手击杀闯军以赚取赏金。
此举也逼得闯王久攻不下，只能后退数十里，第一次进攻开封府便宣告失败，被迫转而攻打别处州县，以补充物资提高闯军士气。
5月初3日，朝廷下令设立南直隶徐州（徐州左卫）、山东承宣布政使司东昌府临清州（临清卫）、北直隶河间府天津三卫、顺天府通州三卫，这四处护漕，以断绝流寇北上之心。
与此同时中原流寇：小袁营（袁时中）与老袁营（袁老山）聚众二十万人，开始进入南直隶劫掠凤阳行都督府泗州（泗州卫）、宿州（宿州卫）、亳州（武平卫）、寿州蒙城县，并号召土矿、刁民们一起造反。
而开封府内的明河南总镇巡抚：李仙风，和明河南总镇巡按：高名衡，两人互相弹劾彼此，都说闯军来攻之际，对方是奸臣没有尽力守城，有作奸犯科之事？
此事被明毅宗：朱由检，得知后，立即发来圣旨，下令将李仙风下狱。
自知没有出路的李仙风，感觉时日无多了！便自杀了事，而明河南总镇巡按：高名衡，就这样被升任为［河南总镇巡抚］。
接着朝廷急调明三司总督兼凤阳行都督府总镇巡抚：朱太典、明庐州府总兵：刘良佐，率领骑兵进剿流寇，追击两袁流寇逃遁五十里地，窜进齐眉山林中。
其中明庐州府总兵还立刻分兵，展开轻兵追击，流寇们则据险扼守，明军们就以火炮轰炸，让流寇防御溃败被迫逃走，在追击二百里导致尸横遍野。
流寇在林中奔跑时或自刎、或投降、或隐居，二十万乌合之众，如飞鸟走兽般散去，以至于大小两袁仅带着数百骑兵逃出，东走渡河入河南承宣布政使司归德府。
同时山东承宣布政使司济南府泰安州流寇十万人，出动劫掠兖州府宁阳县、曲阜县，流寇所到之处焚其屋庐，掠其妇女。
使得城中妇女们多穿甲冑执刀枪守城，直到山东都指挥使司青州府驻军赶来时，流寇们才败走南直隶淮安府邳州（邳州卫）。
接着流寇们又进犯了南直隶徐州萧县，以及南下劫掠扬州府高邮州宝应县，摧毁漕船十六艘，在复攻山东承宣布政使司兖州府东平州（东平守御千户所）。
而南直隶徐州丰县流寇二千人，则围攻丰县，与这股徐州流寇汇合，攻城越来越多，以至于兖州府东平州流寇：李青山，就屯兵在济南府泰安州梁山之中。
6月21日，南北直隶两京、山东承宣布政使司、河南承宣布政使司、浙江承宣布政使司再次大旱，不仅如此中原各地由陕西承宣布政使司开始，还相继出现了较大规模的瘟疫〖黑死病〗。
各地的灾荒四起，也让农民军：西营八大王（张献忠）与革左五营流寇们看到了希望，又开始出兵南直隶安庆府，还攻陷了安庆府宿松县、庐州府六安州英山县。
待流寇攻城的消息传出后，顿时让明三司总督急忙移师到凤阳行都督府寿州（寿州卫）镇守，还下令让工匠们造长枪三千杆，长丈二尺，鸟铳三千杆，并大阅诸军3万人，还决定近期入山搜剿。
7月18日，流寇革左五营攻陷安庆府潜山县，又掉头围攻湖广承宣布政使司黄州府麻城县，当即就被明五司总督：丁启睿，出击大破流寇于黄州府麻城县内，并斩杀了一千二百人。
9月初4日，明陕西三边总督：傅宗龙，带领四川都指挥使司、陕西都指挥使司两万明军东出西安府潼关卫，驻扎在汝宁府新蔡县，与明保定府总督：杨文岳，的军队会合。
然后由明援剿总兵：贺人龙、明陕西总镇总兵：李国奇，率领陕西明军，而明大宁都指挥佥事：虎大威，带领保定府明军，一起架起浮桥，东渡河南承宣布政使司汝宁府赶赴中军都督府直辖地开封府陈州项城县。
接着明陕西三边总督：傅宗龙、明三司总督兼兵部右侍郎保定总督：杨文岳，又联合起来驻扎在开封府陈州沈丘县火烧店村。
而闯军与流寇们则派步兵过来，攻打明军驻扎的营寨，明军们便架起火炮点燃开炮，当场炸死了三百多闯流联军。
等到天色渐渐暗了下来之后，闯流联军们就相继撤退了，明陕西三边总督的军队就在西北、明三司总督的军队在东南，凭借着战壕死守阵地。
可是保定府明军当晚就逃走了，护送明保定府总督趁夜跑到了开封府陈州项城县内，只剩下明陕西三边总督率领下的四川都指挥使司与陕西都指挥使司军队，分别派到东南方向扎下营寨。
各将领们分守壁堡跟闯流联军的战垒相持。
9月初9日，明陕西三边总督传令明援剿总兵：贺人龙、明陕西总镇总兵：李国奇，回师前来援救。
但这两个总兵却不加响应！无奈之下明陕西三边总督只好感叹道“他们避死，想必不来了，难道本部堂也要避死吗？”
随后就对部下们，讲道“本部堂老了，今日陷在贼军包围中，定要与大家一道决一死战，断不可像他人一样弃甲逃走。”
为此还召来明榆林卫镇抚使：李本实，派他过去挨着保定府明军，之前守过的壁堡，继续开挖战壕，堆起战垒用来抗击贼军。
而闯流联军们也挖了两重战壕来包围他们。
9月11日，陕西明军的粮食吃完了，就杀了骡子、马匹给他们吃，但营中的骡马很快也没了，就分食阵亡的流寇、闯军尸体。
到了9月18日，明军营中的火药、铅弹、箭镞，都放完了！
明陕西三边总督就清点士卒，除受伤、死亡的士兵以外，还有六千兵，在半夜时分明陕西三边总督就率领这6千军队偷袭贼军大营，杀死闯流联军一千多人突出重围。