但是四子：思化、五子：思豪，则内奔蛮莫安抚使司，占争蛮莫安抚使司地盘以及官职，甚至还聚众暴横。
然而明蛮莫安抚使：罕送，则因蛮莫安抚使司为孟密宣抚使司所辖地区，又加上外有缅军逼近，内有明孟密宣抚使司同知：思化、明孟密宣抚使司副使：思豪，两人起兵闹事！
且孟密宣抚使司已经丢失，蛮莫安抚使司又无险可守！
最终只得放弃蛮莫安抚使司地界，仓皇内奔一路逃入明军驻地永昌军民府腾越州（腾冲卫）境内，并请求明廷官员们发落。
随后明云南总镇巡抚：萧彦，等官员们见状，便欲扶立明蛮莫安抚使：罕送，使其仍归蛮莫安抚使司镇守驻地。
但云南都司府以及朝廷得信后，却认为不可轻启兵端，故此明云南总镇巡抚便密令明云南府抚夷同知：漆文昌，先前往蛮莫安抚使司处招抚明孟密宣抚使司同知：思化。
随后明云南府抚夷同知就单骑入思化营，宣谕朝廷恩威，而明孟密宣抚使司同知虽然听命接旨，但却说“思顺叛汉（明）归缅，不当有蛮莫安抚使司，吾有助孟养长官使司诛杀缅贼之功，现无所归，愿寄食于蛮莫安抚使司。”
此举被明云南府抚夷同知答应了这一要求，但也更加刺激了已归附缅甸军民宣慰使司兼东吁王朝的思顺，他为了夺回蛮莫安抚使司领土，而多次引缅军来攻。
9月13日，明建州左卫军民镇抚使：佟·努尔哈赤，在统一了建州女真五部之后，就开始在关外向女真各部们颁布国政，自称为〈淑勒贝勒〉还逼迫明建州左卫军民指挥使：松塔，升任他为（军民卫指挥佥事）。
并按照之前万历十一年还未建功立业时，来到海西女真叶赫部的约定娶亲。
因为之前叶赫女真部东城贝勒：纳拉·杨吉砮，慧眼识人将只有9岁的小女：纳拉·孟古哲哲，许配给了爱新觉罗·努尔哈赤。
还答应他，等到小女过成人礼（盘发），长到出嫁之年（14岁）时，一定会把她送往建州女真左卫军民指挥使司与其完婚。
而当时的明建州左卫军民试百户：爱新觉罗·努尔哈赤，是非常愿意与叶赫女真部联姻，以壮大自己势力的。
但是他却很纳闷，因为叶赫女真部东城贝勒的大女儿：纳拉·孟桑，明明已经年满15岁成年了，完全可以现在就出嫁，为何他却要将，这年幼的小女儿许配给自己呢？
在问了这个问题后，岳父叶赫女真部东城贝勒非常真诚地回答道“女真语：大女儿虽然年纪适合，可是她的资质和相貌都很平庸，而小女儿虽然才仅仅只有9岁，可是她天资聪颖，品德出众，这才配得上试百户大人，您啊！”
这句话让当时的明建州左卫军民试百户听后满心欢喜，赶紧打道回府准备了丰厚的聘礼送来，并且耐心等待过些年再来娶亲，也算是叶赫女真部东城贝勒对他的考验，看看今后这个女婿究竟有没有本事？
到了现在时隔五年，已经年满14岁的小女儿：纳拉·孟古哲哲，在兄长叶赫女真部东城贝勒：纳拉·纳林布禄，的护送下，来到了建州左卫军民指挥使司（卫指挥所）费阿拉城内。
此时的新郎明建州左卫军民指挥佥事：佟·努尔哈赤，也早已经是个大名鼎鼎的人物了，他亲自率众出城相迎，便杀牛宰羊大宴成婚。
就连明建州左卫军民指挥使：松塔、明建州右卫军民指挥使：来留住、明建州卫军民指挥使：李以难，也要给他几分面子，亲自前来祝贺婚礼。
席间新娘：纳拉·孟古哲哲，也显露出了她的文华出众。
而这新娘论相貌；她面如满月、端庄妩媚、风姿独具，论修养；她气度宽宏、不喜奉承、不惧恶言、且举止庄重大方、口无恶言、耳无妄听、始终如一，毫无过失。
因此两人结为夫妇，婚后两小无猜。
9月20日，因明甘肃总镇总兵：刘承嗣，约束太严，时常鞭打部下，饷银又不按时供给，惹得部众们遂反抗起事，持刀欲杀明甘肃总镇巡抚：曹子澄，想以此来要挟陕西行都指挥使司都司府发放军饷。
朝廷得知后，立刻罢免了明甘肃总镇巡抚：曹子澄，和明甘肃总镇总兵：刘承嗣，的官职，并发放去陕西行都指挥使司肃州卫（嘉峪关）边疆。
10月初4日，明都察院右都御史兼河道总督：潘季驯，建议河防八事，上奏道“其一；久任部臣，说水性有顺逆，河情有分合，地势有险夷，只有久任才能熟悉情况。其二；责成长令，说理河如理家，今沿河州县长犹家长，调集夫役，备办物料，宜有专责，州府县官亦有总理之责。其三；禁调官夫。其四；预定工科。其五；立法增筑。其六；添设堤官。其七；加帮填土。其八；接筑旧堤。”
这八条治理黄河、长江，决堤之道均被明神宗：朱翊钧，批准录取。
明万历十七年公元1589年3月初9日，因以往被升任授的官员，皆需要入朝觐见皇帝陛下，当面叩头谢恩。
然而久不视朝的明神宗，却再一次令内官传旨道“奏对数多，不耐劳剧，不临朝视政。”
并传令免去在京升任授官们的面谢礼，此后明神宗视朝次数越来越少！但也并非不上朝，只是偶尔临朝听政。
3月16日，因云南承宣布政使司永昌军民府一带，之前招募了川、楚、粤，三处亡命之徒为兵，分立在永昌军民府腾越州（腾冲卫）、姚安军民总管府首府姚州（姚安守御千户所）以及姚安中屯守御千户所两营。
还以明大理府副总兵：刘綎，统领腾冲卫军营，明楚雄府副总兵：邓子龙，统领姚安守御千户所以及姚安中屯守御千户所军营。
由于结果两营主帅均持功骄傲不服对方，再加上管理范围有冲突，导致两营军队相遇之时，发生了斗殴事件，被地方官员们上报朝廷，明神宗又因二将皆有功而视之不见。
仅仅只是把刘副总兵给调走，并换成了明永昌军民府副总兵：刘天俸，上任。
他本人就属于地方土司血统，再加上性格暴躁，经常放纵士兵欺负百姓，因此被抓。
于是明神宗就让明楚雄府副总兵：邓子龙，来兼管两营，但明楚雄府副总兵却偏袒自己的老部下姚安守御千户所以及姚安中屯守御千户所军营将士。
而把苦活累活都让腾冲卫军营将士们来做。
就连吃饭的时候，姚安守御千户所与姚安中屯守御千户所军营将士的膳食，也都是腾冲卫军营的两倍，结果就导致姚安守御千户所与姚安中屯守御千户所军营将士们，均养成了骄奢的习惯，因索要军饷不成，而直接开始造反。
再加上叛军毕竟是职业军人，所以战斗力极其强大。
他们在教场上面树起大旗，杀掠居民，抢夺马匹，声称要赏银，并聚众一路往西过大理府洱海卫、蒙化府蒙化卫，从而杀入永昌军民府永平县（永平守御前前千户所、永平守御右右千户所），但因城门尽闭不得进入。
又逢大理府大罗卫、洱海卫，两处明军追击而来，才迫使叛军们转入大理府首府太和县（大理卫），去沿途剽掠卫所军民。
消息很快就引得明黔国公兼太子太保：沐昌祚、明云南总镇巡抚兼都察院右佥都御史：萧彦，的注意，他俩决定一起督兵夹击，最终斩杀叛军八十四人，俘获六百八十人。
使得叛军们不得已诈降，再败逃云南府安宁州（安宁守御千户所、琅井提举司）、武定军民府首府和曲州（武定守御千户所）、姚安军民总管府（姚安守御千户所）一带地区。
4月初7日，广东承宣布政使司南雄府始兴县僧人：李圆朗，在朔源村下洞水宝庆庵内「造妖书」来煽动人心，还言有易死还生，先天演禽及剪纸为人马之术。
夜间，则飞动并飞劫杀人的诸秘法，诡称韶州府翁源县人：王子龙，为齐冲天将军兼金统帝：黄巢，之后裔？
并且留有金统帝遗产十二窑，愿从者可瓜分之。
又称王子龙乃弥勒降生，子丑年天有大灾，鬼将食人，捐资自投者给米符可免。
就这样经过一番舆论准备之后，妖僧：李圆朗，就与王子龙聚集在南雄府始兴县、韶州府翁源县这两地，聚集了白莲教徒共有数百人，开始发动武装造反。
并分兵到处杀害富商来祭旗鸣金，又出兵攻打南雄府附近县城，声势甚大。
当即来受到了广东承宣布政使司南雄府官员们的重视，还准备集结好乡兵进行镇压，这股白莲教乱军。
很快王子龙就当即被明军抓住斩首示众，而妖僧：李圆朗，则在4月初9日，就被明督察院右都御史兼南赣巡抚：秦耀，俘虏并五马分尸了。
4月20日，明兵部尚书：赵焕，根据明都察院左佥都御史兼福建总镇巡抚：周寀，的建议，以福建承宣布政使司漳州府沿海居民贩海通倭寇为由，规定东、西二洋，各派船只四十四艘，不得超过限额。
6月初6日，北直隶河间府静海县、沧州（沧州守御千户所）、景州吴桥县，一带运河地区突然刮起大风，导致漕船互击淹溺了二十三人，还失去漕米三千一百五十七石。
同时明云南总镇巡抚：萧彦，调集了云南都指挥使司的滇军以及土司兵，对叛军们进行围剿，于6月11日彻底平定。
其中明楚雄府副总兵：邓子龙，也因此被调去广西承宣布政使司境内。
7月18日，漠南蒙古多罗土蛮部首领：孛儿只斤·火落赤，攻击大明陕西行都指挥使司西宁卫境内的僧纲司瞿昙寺。
9月17日，明建州左卫军民指挥佥事：佟·努尔哈赤，在解决了建州女真董鄂部的问题之后，又有董鄂女真部首领：董鄂·何和礼，前来率部投降。