不久火势又蔓延到了城内房屋，变得一发不可收拾，而这虽说是火器不靠谱引发的悲剧，毕竟之前在沈阳中卫时，后金军进攻西门，也是因为大炮炸膛而引起了城头守军们的混乱，导致被敌人浑水摸鱼。
这时城楼上面的爆炸动静，和城外二线明军的混乱，进一步引起了连锁反应，导致城外坚持抵抗的明军们也出现军心动摇情况，意志不坚定者已准备开溜。
就在如此危急时刻，只有明辽东总镇经略：袁应泰，的虎旅军还奋战不止，他们主动护住自己的主帅，并在炮火掩护下撤回城内。
然而逃回城内后，明辽东总镇经略却发觉事态已无法控制，城内城外的明军都各自为战，与敌人打成一团，让各路明军们几乎陷入到了混战之中，根本组织不起来！
这时城外还有大批未来得及撤回的明军主力，他们失去统一的指挥调度，是战是逃全看各自的主将。
因此是时候展现忠诚的机会了！
于是明山西总镇总兵：杨宗业、明东宁卫总兵：梁仲善、明酉阳宣抚使司佥事：冉文焕，等将领率部苦斗敌人，最终力战而亡，更多的明军士兵则是一哄而散。
当然也不要太苛责明军会坚守阵地，毕竟在战场上失去指挥的部队，多半都会是如此，即使到了现代也不可避免。
此刻城内已燃起了熊熊大火，后金军的内应们则乘机高喊道“辽阳卫已陷！大家快逃吧！”
趁此机会，后金左翼四旗终于登上西门城楼，并沿着城墙一路进攻过去，相继占据了左右两面的城墙。
就这样后金覆育英明天命汗：爱新觉罗·努尔哈赤，立即传令后金右翼四旗不要，再继续纠缠着城外明军残兵的抵抗，而是分出主力去登城支援后金左翼四旗。
至此辽阳卫城破，明军再也无力把突入都司府辽阳卫城内的后金军给赶出去。
不过后金军虽然占领了西门，但却并不意味着辽阳卫就已经全线失守了，毕竟周边可是有东宁卫、自在州、定辽中卫、定辽左卫、定辽前卫、定辽后卫，这5个卫一个州的城防与辽阳卫连接在一起。
因此城内的明军们还一直在坚持战斗，抵抗了整整一夜，战况持续到了子时初，双方才停战休息。
3月21日辰时，后金军大队人马已全部入城，他们整兵列阵对着城内的明军们发起最后的进攻。
两军刚接战，后金军为了尽快取胜，就掘开城西闸门以泄濠水，又分兵前去堵塞城东水口，待击败街道上的明军时，交战的后金军便冲到城边，拦截战败的明军们。
以此来逼迫明军向城外跑去，导致洪水冲来时，有的明军被淹死、有的冲入城内被砍杀或乱箭射杀，伤亡惨重！
寅时，明辽东总镇经略：袁应泰，与明辽东总镇巡按：张铨，继续带着将领们退守东宁卫城墙。
而明辽阳卫监司：高出、明定辽左卫指挥使：胡嘉栋、明辽阳卫督饷郎中：傅国，等将领则趁机翻城墙逃走，导致明军人心离散。
等到后金军再次攻城时，明辽东总镇经略又督率明军持盾牌大战，却又败下阵来。
到了戌时，内奸漠南蒙古察哈尔部与漠南蒙古科尔沁部冒充的明军，纷纷在城楼上面放火，让后金军顺利从小西门进城，瞬间城内大乱！
这让明辽东总镇经略：袁应泰，在城楼上见此情况，觉得大势已去无法挽回，便对明辽东总镇巡按：张铨，叹息道“你没有守城的责任，赶紧逃走吧！让我死在这里便可！”
说罢他就佩戴着尚方宝剑和官印，在城东北处的镇远楼上拔剑自刎了，他的妻弟：姚居秀，也跟着自杀，仆人：唐世明，则抱着袁总镇经略的尸体大哭，并放火焚烧城楼而死。
但下了城楼的明辽东总镇巡按却并没逃跑，他依旧选择了抵抗到底，最后被后金军俘虏，在面对后金覆育英明天命汗：爱新觉罗·努尔哈赤，时见他有勇有谋，就想要招降他。
却被一口拒绝。
关键时刻后金四贝勒：爱新觉罗·红歹是（皇太极）再次出面招降，但明辽东总镇巡按却一心只求速死。
就连后金额附三等副将：李永芳，前来劝明辽东总镇巡按：张铨，投降也被拒绝，这倒是让后金覆育英明天命汗认为此人很有大明骨气，便打算关押起来。
可明辽东总镇巡按却受不了侮辱，他觉得自己无脸在回京朝见大明皇帝陛下了，就面朝南边京城方向，行三拜礼后，就自杀殉国了！
不少胆小怕死的守军们，由于封城逃不了就干脆躲到了民房的屋檐之下，但如今已经满城都是后金军的旗帜了。
而当时辽阳卫城内的一些富人们，都盛装来迎，有些富人之前大多数都和后金额附三等副将有勾结，但这种近乎于摇尾乞怜的行为，却并没有保住这些人的生命，反而让后金军把不少军民给轰出城去，在将他们全部屠杀！
当然也有奋起反抗者，其中有一位老书生就用棍子，连续打伤了好几名后金士兵，又联合全家人和结伴的数十人一起逃出城去，部分军民们也相继效仿。
随着辽东都司府辽阳卫附近的失陷后，自杀殉国的高级明军将领并不只有明辽东总镇经略：袁应泰、明辽东总镇巡按：张铨，两人，还有明金复海盖兵备道副使：何廷魁、明辽阳卫监军：崔儒秀、明定辽中卫总兵：牛维曜，等人皆不愿投降后金而自杀殉节。
而辽阳卫之战中，大明仅有三位总兵官阵亡而已，分别是；明武靖营总兵：朱万良、明山西总镇总兵：杨宗业、明东宁卫总兵：梁仲善，更多的明军将领并没有选择战死沙场，而是逃跑了。
但逃跑又分为两种，一种是战事不利，在胜负未分之时就溜之大吉，代表人物是～明辽阳卫监司：高出、明定辽左卫指挥使兼监军：胡嘉栋、明东宁卫监军：韩初命、明定辽中卫监军：牛象干、明自在州总兵兼监军：刑慎言，等人他们都是监军，也因此被人称为「同逃五监军」。
另一种则是战败后突围而逃的，包括明凉州卫总兵：侯世禄、明辽阳卫总兵：姜弼、明奉集堡总兵：李秉诚、明新勇营左参将：鲍承先，等将领以及数万士兵。
因此辽阳卫之战真正的战损并不多，除了一部分投降的明军外，大部分明军都在潜逃，这些人四散逃命，最远的往东逃入了李氏朝鲜王国，最近的则往西跟随大部队撤入了广宁卫一带进行防守策略。
这对于后金覆育英明天命汗来说，攻下辽阳卫就意味着大明帝国在辽东都指挥使司的防御已经土崩瓦解了，毕竟连都司府都沦陷了，辽东都指挥使司还有防守处吗？
故此失去了庇佑的大明军民们，便如潮水一般，纷纷退往辽西广宁卫城内避难，导致了都司府辽阳卫周边大小七十余座城堡、屯，以及辽阳卫附近的；东宁卫、定辽中卫、定辽左卫、定辽右卫、定辽前卫、定辽后卫、复州卫、盖州卫、海州卫、金州卫、金州中左守御千户所、自在州，等处再也无力出兵抵抗后金八旗，只得纷纷投降。
之前对于后金来说〈萨尔浒之战〉只是生存之战，后面的攻城略地也不过是为了一口吃的过冬粮食，可如今的「辽沈之战」才是一次真正的立国之战。
从此后金汗国的势力又大幅度扩增数倍，再加上后金之前的界凡城、萨尔浒城，等都远够不上都城的级别，充其量也就是一个规模稍微大点的寨子而已。
这对一个新生政权来说，没有个像样的城堡乃至都城是极其难堪的，而辽阳卫又是个极其理想的都城对象。
至此辽阳卫与沈阳中卫乃至辽南等地卫所的失陷，导致了沿海居民们皆航海逃往山东承宣布政使司。
而无力到达者，要么就滞留在各岛屿之间、要么进入李氏朝鲜王国避难，还有一些未逃走被后金抓住的，男子无论军民一律都要剃发易服，在充入披甲人或者包衣奴才行列中。
好在明定辽右卫都司：毛文龙，正率领援军在此准备招集逃难军民为兵，在分布哨船，连接登州卫，以为犄角计。
此刻前去辽东都指挥使司探查情况的，明兵科给事中：朱童蒙，开始回来上奏全面陈述了前任熊总镇经略的所有功绩。
还十分深动的说道“臣进入辽地的时候，军民都对他垂泪称道，说几十万生灵都因为熊总镇经略一人才得以保存，他的罪行怎能轻易确定呢？只是熊总镇经略最为陛下所信任，之前蒲河守御千户所战役中，敌人进攻沈阳中卫，他驱马前往救援，胆量是何等壮大！等看到官兵懦弱时，就突然告老还乡去了，这样把陛下对他的大恩置于何处了呢？熊总镇经略虽功在存辽，些微的成绩虽有可称，但罪在辜负了圣上，根据君臣大义而论，他是无法逃脱罪责的，这就是罪浮于功！”
待明熹宗：朱由校，看到这本奏折后，他认为熊廷弼力保危城有功，仍打算日后重新起用他。
4月初6日，辽东都指挥使司重镇沈阳中卫、辽东都司府辽阳卫以及辽南四卫等地相继失陷，而明辽东总镇经略：袁应泰，畏罪自杀，辽河以东全部沦为后金土地的事情传入紫禁城后。
让大明群臣们大为震惊！明熹宗伤心之余但还是按照惯例，追封明辽东总镇经略：袁应泰，为〈兵部尚书〉并举行隆重葬礼，又封其长子：袁楷，为（都察院右佥都御史）。
随后明南直隶兵部左侍郎：张鹤鸣，奏请明熹宗要厚待明石柱宣抚使：秦良玉，的家人！
于是明熹宗便下诏给明石柱宣抚使：秦良玉，要加封她为〈从二品武将～定国将军〉的官服，并赐明石柱宣抚使兼定国将军：秦良玉，为（诰命夫人）还把石柱宣抚使司升为［石柱宣慰使司］。